смотрите по каким критериям маркируются пакеты - Mark-packet-forQueue
все там делается, в маркировке, исключите указанные диапазоны и пакеты не будет маркироваться, шейпер на нах срабатывать не будет.
добавлю.
у вас тут мешанина, и простые очереди и PCQ, вы определитесь, как надо. PCQ конечно лучше, но надо понимать что и как в сети и роутере происходит, как пакетик идет от SRC к DST.