боты:? посмотрите реальный юзерагент и поведение этих пользователей на сайте.

Заглушка должна возвращать HTTP 503, чтобы поисковики не индексировали ее. Для этого подойдет любой хостинг с php:

<?
header('HTTP/1.1 503 Service Temporarily Unavailable');
header('Status: 503 Service Temporarily Unavailable');
echo 'Упс, и такое случается. Наш сайт временно недоступен по причине бла-бла-бла.';
?>

1 и пожалуй самое важное: Используйте ту ОС, которую лучше всего знаете, ибо ответственность за ее работу будет на вас, не на знакомом «линуксоиде».

2. Все вышеперечисленное (шлюз, базы, бэкап) на одной машине — худшее, что можно придумать и реализовать. Все три роли должны быть на разных устройствах, дабы: не взломали шлюз, не украли базы и не стерли бэкапы.

просто указать путь к ключу:
ssh -t -i /path/to/key user@host command