Это зависит от того умеет ли делать это Ваш BIOS. Обычно BIOS для десктопов/ноутбуков такого делать не умеют. Тем более, что загрузчик скорее всего установлен только на первый диск, и без него Ubuntu просто не запустится.
Решается такая задача разными способами:
- Установить загрузчик Ubuntu на диск с Ubuntu, чтобы она штатно загружалась, а первый диск отключать физически когда это требуется
- Прежде чем что либо делать с ОС читать документацию и понимать что делаешь
, а не только howto
- Эксперементировать с Ubuntu на виртуалке, а не на физической машине
