Рабочее окружение современного разработчика. Мобильное, быстроразворачиваемое, вандалоустойчивое?

Много заботы в Вашем ответе. Правда, все мимо кассы, но зато с душой!
Планирование рисков? Не, не слыхал.

Существует ли хорошее приложение для конспектирования своей базы знаний?

Проголосую за этот вариант. Тем более, если нужны диаграммы.

Вот тоже неплохой проект https://www.mindmeister.com
Бесплатного функционала вполне достаточно для личного пользования.
Возможно расшаривание.