paran0id

Всё просто. Линукс же на systemd, скорее всего?
Читаем доку: https://www.freedesktop.org/software/systemd/man/s...
Создаём one-shot сервис, прописываем в Exec команду, что должна выполняться
Делаем enable этому сервису, проверяем.
Ещё можно сделать timer, чтобы запускался не только при загрузке, а по расписанию периодически.

Именно файл парсить надо? Я бы рассмотрел получение логов через journalctl.

Пишешь правила, какие логи из какого источника куда сохранять, кладёшь в /etc/rsyslog.d/

Почитать можно тут:
https://access.redhat.com/documentation/en-us/red_...

Берёте unit-файл sshd, скорее всего это будет /lib/systemd/system/sshd.service
Копируете его в, например, /etc/systemd/system/sshd_new.service
В полученном файле прописываете путь к новому исполняемому файлу, где он там лежит, и конфигу (в котором должен быть другой порт указан), например так:

ExecStart=/opt/my_new_sshd/sshd -f /etc/my_new_sshd_config.conf

Сохраняете файл, затем от рута:

systemctl daemon-reload
systemctl enable sshd_new
systemctl start sshd_new

И всё готово.

говорим iptables-save и смотрим, есть ли правила, потенциально ограничивающие ваши запросы
исключаем nginx - шлём запросы непосредственно в gunicorn, замеряем результат
мониторим количество соединений
смотрим логи на предмет too many open files