Богдан Лашков,
Сама 1С установлена на SSD
Поподробнее пожалуйста - система, профиль пользователей это все на SSD? Какой SSD - модель, емкость, наличие RAID. Неплохо бы посмотреть во время тормозов очередь диска - внимание диск интересует тот на котором система и профили пользователя. Тот диск, где базы лежат, не сильно интересен.
загружает 16ГБ ОЗУ только на 70%
Сколько у вас пользователей? Речь идет об активных пользователях, которые одновременно активно работают в одной базе.
Сами базы большие (1-2 ГБ)
Большие это хотя бы больше 10гб, а это крохи.
Не подскажите, пожалуйста, в чём может быть проблема?
Есть подозрение что проблема в количестве пользователей - тупо блокировки. Чтобы точно сказать - мало информации.