o5a

Приведите пример данных. Возможно запросы не соответствуют структуре.
Из того, что есть, вижу 2 ошибки
s = str(elem["sip"] + '\n')
если elem["sip"] не текстовый, то подобная конструкция выдаст ошибку, т.к. str не правильно использован.

f.readlines()
...
    if elem["sip"] in f:

проверка не будет работать, т.к. f пустой, readlines() уже перемотал указатель в конец файла.

Судя по всему пытались сделать это

print(Fraction(130296 % 27, 100))

по факту просто
130296 % 27
если нужно только натуральное число, причем тут дробь вообще из контекста не ясно

to_json формирует текстовую строку формата json из словаря данных dataframe
to_dict формирует сам словарь

Соответственно, если пытаетесь сделать так:

dx = df.to_json(orient='split')
datajs = json.dumps({"datj": dx})

то datajs - это строка, а не словарь, поэтому брать от нее значения по ключу не получится
"datj" нужно брать не от datajs, а от dx

dx = json.loads(datajs)
dg = pd.read_json(dx["datj"], orient='split')

И если как написано изначально, вы передаете json в параметре x = json.damps("y": y, "dataframe": dataframe)
то можно в "dataframe" передать словарь, который потом и закодируется в json через dumps

x = json.dumps("y": y, "dataframe": df.to_dict(orient='split'))

Основная ошибка здесь:

cop.split(',')
вместо
cop=cop.split(',')

Из-за этого последующий ' '.join(cop) формирует не строку разных путей, а разбивает путь пробелами.

По поводу extend не особо понятно, что добавлять, не описано, для чего вообще этот дополнительный кусок? Если цель просто повторять создание архивов из разных мест, то не нужно было делать эти манипуляции с cop

Просто общий бесконечный цикл, в конце которого запрос повторения

while True:
    # полностью первый блок кода с запросом данных и архивацией
    # после него
    repeat = input("Повторить (y/n) ?"
    if repeat != "y":
        break

Для работы с zip еще есть модуль zipfile.

Можно ли как то с помощью базы данных вытаскивать последовательность ответов пользователя и в конце на основании всех ответов выводит какой то текст.

Так вопрос в том, как хранить данные этих опросов в базе или хотите полностью переделать систему опроса. Ведь сейчас диагноз итак формируется.
В базе хранить лучше не в логике последовательности, а просто заносить все параметры. Т.е. таблица примерно с такими полями
id - автоматически увеличивающийся идентификатор
user - идентификатор/имя пользователя
animal_type - вид животного "Дельфин" и т.п.
temperature - температура
и т.д., т.е. все запрашиваемые параметры в отдельном поле.

Тогда можно в любой момент будет сделать запрос в базу данных как по пользователю, так и по id опроса, и по этим данным опроса выдать диагноз.

Например, выдать данные последнего опроса выбранного пользователя:

select anymal_type, temperature, ... from table where user = <user> order by id desc limit 1

Если цель - сгруппировать данные товаров по каждому пользователю, можно заносить их в словарь, а затем объединить через join. Пример

back_result = [
['ivan', 'ivan1', 'apple', '312', 3],
['ivan', 'ivan1', 'corn', '312', 5],
['ivan', 'ivan1', 'mac', '312', 1],
['ivan', 'ivan1', 'band', '312', 2],
['marc', 'marc22', 'pine', '6312', 23],
['marc', 'marc22', 'apple', '6312', 30],
]

from collections import defaultdict

user_products = defaultdict(list)
for name, user_name, prodect, phone, quantity in back_result:
    user_products[(name, user_name, phone)].append([prodect, quantity])

for user, products in user_products.items():
    print("Имя: {}, user_name: @{}, Телефон: {} ".format(*user) + ', '.join(f"{product} {quantity}шт" for product, quantity in products))

Результат:

Имя: ivan, user_name: @ivan1, Телефон: 312 apple 3шт, corn 5шт, mac 1шт, band 2шт
Имя: marc, user_name: @marc22, Телефон: 6312 pine 23шт, apple 30шт

Не понятно, причем тут другой сайт, но если вопрос в том, как выделить класс, то так.
Сохранить весь класс InBot в файле, например inbot.py в той же папке, где main.py
затем просто импортировать в main.py

from inbot import InBot

my_bot = InBot('./data.txt')

Если речь про то, чтобы импортировать из файла с другого сайта, то никак. И непонятно, как такая задача возникла.

С примером Вашего кода было бы понятнее, но вообще это можно сделать так:
df.loc[dfi['index']]
df - DF с данными
dfi - DF с индексами в колонке 'index'

a = ['с1', 'с2' ]
print("\n".join(a))
# с1
# с2

Для создания нужного имени можно использовать форматирование строки или f-строки.
strftime для нужного формата даты.

import datetime

N = "work"

filename = "old_{}_{}.txt".format(N, datetime.date.today().strftime("%d-%m-%y"))
print(filename)

Для проверки существования файла os.path.exists(путь_к_файлу)
Для переименования os.rename(откуда, куда)