nictrace

1. php выполняется не сам по себе, а через веб-сервер, например апач
2. апач содержит несколько воркеров, каждый из которых поддерживает фиксированное количество потоков (например, 100)
3. ваш долгий скрипт будет заставлять ваш броузер вращать ожидалкой, но это не помешает работе остальных клиентов
4. если вы запустите долгий скрипт в паре тысяч окон - можно заДДОСить сервер, так как у него кончатся свободные потоки.
5. если сервер оборудован защитой от атак - он просто забанит назойливый IP адрес, чтобы не упасть

если чип залочен, его можно только стереть. Если настройка фузов вырубает последовательный программатор, придется использовать для сброса параллельный. Я для такой цели как-то паял программатор под LPT-порт, только там была tiny12

В документации сказано, что длительность входящих сигналов должна в любом случае быть не короче двух тактов. Внутренний это будет генератор, внешний кварц или внешняя RC-цепочка - не принципиально.