Proto Recv-Q Send-Q Local Address Foreign Address State PID/Program name
tcp 0 0 127.0.0.1:80 0.0.0.0:* LISTEN -
100:1 что суперкодер, считающий битрикс отстоем, доработал стандартный компонент и поломал кэширование.
Сайт на 1с-Битрикс.
Вот и проблема.
Дальше читать не имеет смысла.
Текст запроса значения тоже не имеет - нужны данные о самих таблицах: размер, индексы, типы полей, по которым идут джойны.
Сайт старый, работало много разных специалистов, каждый оставил свои костыли, так что будем искать затыки в php