megagogo

Если открывать их требуется для личного использования, просто открывать, то можно установить расширение для Chrome, к примеру такое: Clickable Links
Если для структурирования данных и выкладывания в сеть для общедоступного использования, то, чтобы все это привести в порядок, то, либо ручками, либо регулярными выражениями, либо скриптом.

в нотепаде ctrl+h включаешь регулярные выражения и заменяешь

((https?:\/\/)?(?:www\.|(?!www))[^\s\.]+\.[^\s]{2,}|www\.[^\s]+\.[^\s]{2,})

на
<a href="http://$1">$1</a>
возможно регулярку нужно будет поправить, тут уж по ситуации

Писал такое много лет назад как свой первый проект, получился стиль - файл конфиг инклудится в начале, файл вывода в конце, между ними сам файл модуля с обработкой контролеров по свитчу. Сложностей при базовом знание пхп нету, возникающие проблемы гуглятся без проблем, но кроме самообучения толку в это ноль.
НО первое правило написания своей цмс. - Не пишите свою цмс