Пума Тайланд, ах вот оно что. Вы мне глаза открыли насчет того, что это отдельная база.
Я короче решил вопрос.
Обновил общий пакет mysql-common и php7.3-mysql, чтобы сфинкс мог общаться по протоколу mysql на порту 9306.
Затем заюзал в проекте этот sphinxql query builder.
Вдруг кому пригодится.