сколько пользователей будет?
если не больше 5 то рекомендую TrackStudio, она очень гибкая, можно свои веб интерфейсы делать и писать скрипты для работы, ну там много чего www.trackstudio.ru/
но у нее персональная лицензия на 5 человек максимум!
Советую TrackStudio, готов отвечать кармой.
Многоуровневые задачи есть и не просто так: настраивается доступ на любом уровне. Также есть контроль доступа к полям, сообщениям и т.п.
Если у вас много проектов, несколько команд или несколько заказчиков, вы вряд ли найдете что-то лучшее (тем более за такие деньги).
