Наиболее простым способом будет не использовать автоматический бутстрап ангуляра:
1. Загрука конфига (либо через XMLHttpRequest, либо через Jquery)
2. Обработка конфига, регистроирование константы.
3. Бутстрап ангуляра.
Простой пример
jsbin.com/vanoliyo/2/edit
Но более правильным способом будет путь минимизации запросов к серверу, чтобы не приостанавливать бутстрап приложения и не ждать двух последовательных запросов. Как это сделать - сногое зависит от окружения.