Node.js быстр, но существуют вещи, которые необходимо знать, чтобы использовать его правильно.
На самом деле нода, это мощная штука, специально заточенная под определенный круг задач, высоконагруженные системы и тому подобное. Любое не правильное или даже сказать не полностью правильное его использование оборачивается на больших проектах большим минусом, что собственно и спрашивалось в вопросе выше. Чтобы избежать всех таких минусов, нужно практиковаться и учиться на своих и чужих ошибках, и только со временем и опытом можно действительно понять насколько хорош этот инструмент.
Владение нодой в плюсах или минусах в большинстве случаев зависит от полноты его знания, теории, практики, владения и умения применить эту технологию в целом ко многим проектам.