Руслан Федосеев

а что в реджекты то записал? там то и написано, что не позволило применить патч

хостинг
перенос сервисов с другого компа
адреса в разных подсетях - например в одном влане есть и серая сеть, и реальная. Часть систем видна только в серых адресах, часть только в реальных, а часть в обоих..

update some_table set ts=now()

ровно то, что вы задумали ;)

yum.conf
proxy=http://a.b.c.d:xxxx/

указано?

от чьего имени выполняется команда в кроне?

Ответ на ваш вопрос в первом предложении. Найдите того, кто понимает ;)

Надо проанализировать логи сервера, исследовать измененные файлы, посмотреть список запущенных процессов, проверить контрольные суммы бинарников системы..
rkhunter, мозги и вперед.

Региональные настройки - это локаль. Вот и смотрите, как настраивать локаль, как назначить ее себе при входе...

/etc/rc.local
просмотрите стартующие сервисы... видать где то сидит добрый скриптик и меняет вам пароль ;)

1. Нанять администратора.
А он уже пусть разбирается с обновлениями и всем остальным....

diff ?

https - или все, или ничего

может другими, не компьютерными методами решать проблему?

innodb таблицы хранятся в ibdata файле, а не в каталоге базы. Поэтому innodb вам удастся восстановить только полностью

Лучше все таки mysqldump

если письма приходят на этот сервер - посмотрите в каталог /var/mail

так и прописать
*.dev.ru 127.0.0.1

в список самого необходимого mysql входит? посмотрите его параметры.