Александр Джуринский

Если нет желания париться с установкой пакетов и их зависимостями и еще нет данных на сервере, то скорее для вас будет проще установить Debian 7.

Если найдется желание установить нужную версию, то можно просто собрать нужную версию с помощью phpbrew или phpenv.
Лично привык использовать phpbrew. Пример установки PhpBrew. Менеджер версий PHP. (+ установка и испол...

Вам не хватает просто VRRP между 2 серверами, чтобы при недоступности одного из серверов, его IP адрес брал себе второй сервер. В этом случае, сайт будет доступен по 2 A записям.

К сожалению, да же последний Chrome, кеширует только первый попавшийся IP адрес из полученных от DNS. И в случае, если IP адрес станет недоступен, браузер не делает повторный резолв для получения других IP адресов. По этой причине и нужно перебрасывать IP на второй сервер.

TTL в одну минуту это очень сильно. Нагрузка на NS серверы будет чрезмерная. С рабочим VRRP, такой TTL вам не понадобится.

Подобная услуга VRRP между дата-центрами имеется, к примеру, у Selectel

Zabbix + Munin уже стандарт де-факто. Можно мониторить все что угодно.
Для отслеживания изменения в файлах можно поставить: AIDE как одно из простых решений, etckeeper инструмент по серьезнее.
Если хотите просто отчет по серверу получать, то logwatch

Данные от DDoS атак лучше получить от вашего хостинг-провайдера. Они скорее всего собирают статистику с сетевого оборудования Flow Spec'ом и знают какой трафик куда пришел.

PS: это самые простой набор инструментов с чего можно начать