А а сколько у вас там выбрано в поле "отобразить на страницу"?
phpmyadmin к mySQL никакого отношения не имеет, это просто интерфейс отдельно для визуального управления и какие то баги одного к другому отношения не имеют.
Что то тут не сходится, 70Gb SSD и 500Gb DB?
Но сталкиваясь с импортом объемных данных уверен что у вас растет не сама база а bin log и косяк тут в том что вы использовали дефолтные настройки сервера, нужно по инструкции настроить ограничения на время хранения bin log.
Делаете доступ только из приватной сети с помощью VPN, это будет доступно вам из любого устройства и уже никто не пробьет.
К MySQL нужен доступ из внешних источников? Там вообще доступность должна быть только из локалхоста и открывать доступ без лишней необходимости нет...
еще же все зависит от конфигов на сервере, возможно там используется кеширование, а вы нет!?
версии одинаковы mysql? возможно при экспорте/импорте поменялся тип таблиц?
вариантов уйма, скрины тут никак не помогут если вы четко видите что ничего не упирается в железо.
там всего 6 или 7 функций с измененным названием, есть куча софта/скриптов который делает переход за вас
в любом текстовом редакторе есть функция поиска по файлам, вручную все сделать минут 15