ky0

Покажите лог, в котором видно, что запрос к файлу в каталоге

/home/www/project.ru/project/deployment/collected_static/static

получает 404 ошибку.

Скорее всего, что-то с путями или разрешениях к каталогу/файлам напутали.

В зависимости от ключей сборки nginx может искать основной конфиг в разных местах. Чаще всего это /etc/nginx, уточнить можно, посмотрев вывод nginx -V. В основном конфиге указываются каталоги и отдельные файлы, которые применяются вдобавок к основному конфигу.

Так и пишите в файле:

geo $whitelist {
...
 }

У вас зачем-то 80 порт и апач, и нгинкс слушают - проблема в этом. Перевесьте апач куда-нибудь, имхо.