Сам новичек, но пару дней назад делал что-то подобное. Создать свойство для этих айтемов в инфоблоке в нужном формате, заполняешь у парочки айтемов, потом гугли "вывести свойство инфоблока".
Там вроде что-то типа:
<? echo $arResult['DISPLAY_PROPERTIES']['СИМВОЛЬНЫЙ_КОД_СВОЙСТВА']['DISPLAY_VALUE'];?>
Собирал карту не зная ничего.
https://yadi.sk/i/YMDR65DzdCeqpA - получается вместо глобальной переменной #REGION_TAG_YANDEX_MAP# которая у меня идет из шаблона, ты подставляешь свойство с координатами.