Наверно, придется использовать синтаксис с двумя формами, но создавать файл перевода с русского на русский, где переводить только множественные формы:
msgid "%d день назад"
msgid_plural "%d дней назад"
msgstr[0] "%d день назад"
msgstr[1] "%d дня назад"
msgstr[1] "%d дней назад"
