в простом случае будет по новому разметить новый диск и склонировать туда Manjaro
# rsync -aAXHv --exclude={"/dev/*","/proc/*","/sys/*","/tmp/*","/run/*","/mnt/*","/media/*","/lost+found"} / /path/to/backup
подробнее смотри
Rsync#Full_system_backup
потом правим /etc/fstab и обновляем grub
когда система заведётся на новом диске далее уже думать об удалении ненужностей на старом диске
