Лучше выбирать по 1000/5000 записей получать максимальное значение id (PK) и идти дальше, смещаясь по primary key. where id > ? limit 1000 order by id asc
Limit/offset не гуд на больших объемах - так как, к примеру, offset 10000 limit 1000 переберет 10к строчек чтобы отдать 1000
