Действительно - проще всего с .phar файлом в конкретном проекте.

Версию PHPUnit ставьте 3.7.XX. С четвёртой версией в PHPStorm 7 пока что баг с запуском тестов (в PHPStorm 8 EAP вроде починили). Вручную из консоли всё работает, а вот из PHPStorm - ругается.

Как запустить:
1. Создаём структуру проекта, как по данной вами ссылке:

|-src
|   |-autoload.php
|   |-Money.php
|
|-tests
    |-MoneyTest.php

В файле autoload.php нужно подключить файлы, которые вы собираетесь тестировать.

<?php
require_once __DIR__ . '/Money.php';

2. Настраиваем конфигурацию PHPUnit:
Run -> Edit Configurations...
В левой верхней части появившегося окна жмём зелёный плюс и настраиваем конфигурацию:
- устанавливаем Test Scope на 'Directory' и указываем путь к папке tests

- жмём на гаечный ключ и настраиваем путь к phpunit.phar (если у вас локально используется папка с PHPUnit - то подключаете её в File -> Settings -> ProjectSettings -> PHP ... Include Paths, и затем в настройках PHPUnit переключаем на Load From Include Path).

- также указываем default bootstrap file на наш autoload.php, где подключаем классы, которые собственно будем тестировать (где лежат сами тесты мы указали для PHPUnit в начале).
- Жмём Apply -> Apply -> OK

Всё, теперь рядом с созданой конфигурации на панели PHPStorm появилась зелёная стрелка для запуска тестов. Жмём, и если всё правильно - получаем зелёную полосу.


Т.е. процесс настройки - это три шага:
1. указываем где лежит PHPUnit
2. указываем где лежат тесты
3. указываем где лежит загрузчик тестируемых классов.

Вроде всё.

1. Читаем мануал по namespace в PHP. Обязательно пригодится.
2. Запись \DateTime() означает, что нужно использовать встроенный тип DateTime() который есть в PHP (он находится в корне пространств имён, т.е. начинается с '\' хотя если нет конфликтов, то слэш можно не указывать). Например у вас есть свой класс DateTime, находящийся в вашем собственном пространстве имён MySpace.

Какой-то ваш файл app/MySpace/DateTime.php:

<?php
namespace MySpace;

class DateTime {...}

Где-то в своём index.php вы используете его:

<?php
...
...
require_once 'app/MySpace/DateTime.php';

// если мы хотим создать объект СВОЕГО КЛАССА:
$myDateTime = new \MySpace\DateTime();

//Или так:
use \MySpace\DateTime;
$myDateTime2 = new DateTime();

// а вот если хотим использовать встроенный класс DateTime в данной ситуации:
$intDateTime = new \DateTime();

Так что, если вы хотите использовать в определённый момент именно встроенный тип данных PHP, то безопаснее вписать слэш перед именем файла - избавляемся от неоднозначностей.