Нужно вот так:

clean_text = clean_text.replace(/(\.)([A-ZА-Я])/g, '$1 $2');

Тут можно посмотреть описание структуры этой регулярки и результат ее работы regexr.com/3cfpp .
Тут документация по String.prototype.replace() и по регуляркам.
В этой регулярке используются такие штуки как захватывающие скобки в регулярке и подстановка сопоставившейся подгруппы ($n или $nn) в String.prototype.replace().