Как ещё один вариант. Взять готовый модуль выгрузки bitrix для 1С. Он доступен для скачивания с официального сайта. Этот обмен, при всех своих недостатках, всё равно умеет выгружать остатки с ценами в разрезе складов 1С. Можете выгрузить в файл (xml) результат его работы и написать загрузку таких файлов со стороны сайта. Будет практически типовое решение.
Для передачи данных на сайт в этом решении используется php скрипт. Если вам такой вариант не подходит, вам надо будет самостоятельно придумать способ передачи данных. А если подходит, то нужно будет написать свой php скрипт, который будет записывать данные а базу, что всё равно приличное количество работы.
p.s. 50000р. скромно за такую работу.