Есть два варианта работы с GPS: напрямую рчерез COM-порт и через GPS Intermediate Driver API.
Рекомендованный вариант — использовать GPS API
доступен в CE6, но только если он был вкомпилен в ОС.
Если нет — в WM5 есть реализация виртуального COM-порта для GPS, который уже можно использовать совместно. Есть ли он в СЕ — не знаю, никогда не слышал. Но можно написать/найти драйвер виртуального COM-порта с теми же функциями и использовать.