ну раз ты задаешь такой вопрос - значит ответ вида "спарсить в любой удобный формат, а потом уже перенести это в свое БД" тебе ничего не даст.
а значит иди на фриланс. если повезет - найдешь кто это сделает за тыщи 2 деревянных.
вы путаете 2 действия. первое - это придумать эту крупную бд. тобишь продумать структуру и зависимости. которые делают к примеру в том же workbench.
а вот второе уже создать эту бд. там уже пофиг. и делают кому как удобно. кому в phpMyAdmin, кому в консоли.