Это основы основ JS.

Вы пушите функции, которые позже используют переменную "i", а не примитив. Изучайте замыкания и области видимости.

P.S. Через несколько лет можно будет использовать let (ES6), чтобы избежать такое.

Введение в HTML5 History API

Столько бреда понаписали в ответах и комментариях...
Проблема здесь исключительно в кривом запросе. Вы выполняете произвольный js код в теле запроса, это всегда будет ОЧЕНЬ медленно.
{$where:"this.isDeleted == false"}
Нормальный запрос будет выглядеть так:
{isDeleted: false}

Поменяйте и сравните скорость еще раз. Всегда избегайте $where, он используется только для сложной логики, также в таких запросах НЕ используются индексы.