В их репозитории как раз и лежит Dropbox integration for nautilus (nautilus-dropbox), который очень редко обновляется (это всего-лишь меню для nautilus).
Чтобы обновить сам бинарный клиент Dropbox`а, достаточно выполнить следующие команды в терминале:
$ dropbox stop
$ dropbox status #Должно высветится «not running»
$ rm -r ~/.dropbox-dist/
$ dropbox start -i
После чего бинарный клиент будет скачан последней версии.