Не совсем понятен вопрос.
Если под "номером" элемента массива вы подразумеваете индекс, то для многомерного массива индекс будет составным, а не единственным числом. Например:
mls_scc[0][0][0] # -> BV6
В этом коде вы передаете в переменной index список, а должны передавать единственное значение.
input_ssc_level = rd[rowm[1][0].index(index)].value
Напишите вот так, что бы увидеть что попадает в эту переменную:
for rowm, index in mls_scc:
print(index) # -> ['BV7', 'BX7', 'BZ7', 'CB7', 'CD7', 'CE7', 'CG7', 'CI7'] -> ['BW7', 'BY7', 'CA7', 'CC7', 'CF7', 'CH7', 'CJ7']