$pid = getmypid(); и сохранить его в файл допустим тоже. Другой $pid - другой процесс значит успешно перезапустился
exec('php script.php');
$text = strip_tags( $text, '<p><br>' ); может вы имелли ввиду str_replace? Далее лучше на регулярках делат т.к. в коде может быть<p> <br> или <p>
<br>
SET `username`='$username', `password`='$password'