$pid = getmypid();
и сохранить его в файл допустим тоже. Другой $pid - другой процесс значит успешно перезапустился exec('php script.php');
$text = strip_tags( $text, '<p><br>' );
может вы имелли ввиду str_replace? Далее лучше на регулярках делат т.к. в коде может быть<p> <br>
или <p>
<br>
SET `username`='$username', `password`='$password'