>> будет проверять одно кастомное свойство и по нему изменять корневой раздел
Если вы так будете делать, то в мужские товары могут попасть и другие "не мужские" товары.
Проще изначально создать нужную структуру каталогов, а потом по определенным атрибутам привязывать их к соответствующим каталогам.