Аппаратные рейды это для очень, очень, очень узкой ниши, я честно говоря даже с трудом представляю для какой именно.
Программный рейд во первых проще, во вторых безопаснее т.к. если у вас что то сдохнет то вы это что то спокойно восстановите, а если у вас сдохнет рейд контроллер то будут проблемы.
В третьих нормальные рейд контроллеры стоят достаточно дорого. А разница в скорости будет заметна только если у вас в качестве сервера селерон-800 какой нибудь.
А и да, ни в коем случае не используйте fake-raid т.к. эти замечательные устройства вобрали в себя все недостатки обоих решений…