Если вкратце: установить и активировать xdebug, Тут все довольно просто про установку, а тут и тут про то, как научить xdebug вещать туда, куда нам нужно. Далее создаем ssh туннель между сервером и ПК с phpstorm. Остается только указать phpstorm настройки для ssh туннеля.
Установка и настройка xdebug на сервер:
https://www.jetbrains.com/help/phpstorm/configurin...
Настройка удаленного дебага через ssh туннель:
https://www.jetbrains.com/help/phpstorm/remote-deb...
Все то же, что и выше, только по-русски: tokarchuk.ru/2017/07/remote-xdebug-behind-nat