Для сохранения информации из веба использую плагин для FF ScarpBook. Древовидная структура, тэги.
Для списка дел - GoogleCalendar.
Справочник, который всегда под рукой - Evernote ( + соответствующие плагины для браузера).
Чтобы отложить для "прочтения на потом" - Instapaper.
При закачке софта/вареза сопутствующую информация сохраняю в mht и полученный файл затем храню вместе с софтом.