смс сохраняются, это почти официально
со звонками мутнее, но, думаю, тоже у подозрительных или у всех в течение какого-то времени
местоположение записывается постоянно, если раньше органы могли делать запрос только при особо тяжких, теперь это вообще рутинная процедура (правда, запрашивается не конкретный номер, а все вокруг места события, насчет конкретного, кажется, все же нужно решение суда)
звонки и смс шифровать можно, но проще скайп и телеграм
