В Ubuntu используется gnome-terminal, а настройки хранятся в dconf по пути /org/gnome/terminal.
Сделать резервную копию всех настроек можно так:
dconf dump /org/gnome/terminal/ > terminal-backup
Восстановить всё из файла terminal-backup можно так:
dconf load /org/gnome/terminal/ < terminal-backup
