raid 60 — надёжнее (я бы всё-таки выбрал этот вариант)
raid 10 — быстрее (в данном случае по большей части зависит от производительности контроллера)
по дисковому пространству потери на избыточность будут одинаковые.
по поводу работы с дисками.
1. если у вас аналоги Intel X25-E (подозреваю, что это скорее всего так), то их можно ставить на любой контроллер без проблем и размечать полностью.
2. если у вас нечто на MLC-чипах и не последнего поколения (vertex 3 сотоварищи), то либо использовать их с raid-контроллером и осью, умеющими trim, либо не использовать вообще =)
3. если MLC, но свеженькие, то можно использовать и без trim'а, но при этом крайне желательно размечать не весь объём накопителей. оставив 10% неразмеченным — увеличиваете срок службы в два раза. я бы оставил ~50%, что без trim'а, что с ним.