Писать свою систему ведения учёта это, конечно, опыт колоссальный, но только подумайте - является ли это приоритетом Вашего бизнеса? Уверен, что времени это отнимает массу и вряд ли когда-то оправдаются такие трудозатраты.
На мой взгляд, после года (почти) использования онлайн-бухгалтерии, основной её плюс - это постоянное информирование о любых изменениях в законодательстве, введении новых отчётов и прочих "новостей" от государства.
Насчёт стоимости сервисов - я бы не сказал, что сейчас они дороги. Мы в блоге недавно опубликовали обзор этого рынка в России. Если кому-то будет интересно, можете почитать здесь:
ahalogo.ru/buh-online 
