Photoshop, Office 2010 — лучше действительно в виртуалке.
IDE — Eclipse или Netbeans — принципиальной разницы нет. На всех перечисленных языках можно писать.
Торрент — qBittorrent или uTorrent под wine.
PDF — дефолтно работает, как уже выше написали.
7zip — sudo apt-get install p7zip — и будут 7z-архивы открываться, а остальные и так пашут.
Вообще главное ещё при установке поставить галочку, подтверждающую установку закрытых кодеков.
Видео — smplayer или gnome mplayer. Если с субтитрами что-то смотрите, то smplayer более корректно кодировку определяет.
Аудио — deadbeef, если не надо сложного. Ну или Banshee из-коробки, если нужны плюшки типа last.fm.
____________
Из относительно простых текстовых редакторов совершенно верно выше Sublime Text 2 посоветовали, тож советую.
_______________
И совершенно точно не нужен никакой аналог CCleaner'a для вообще любого линукса — это вам не windows засоряющийся.