arch1tect0r

Возможно, что вопрос для ТС уже не актуален, но всё же отпишу.
Разница будет в количестве багов и стабильности дистрибутива - это как важный факт. Также могут различаться версии пакетов, так например Debian по версиям пакетов как правило отстает, потому что там стабильность на первом плане, а вот Ubuntu впереди относительно Debian, но из-за этого могут быть неприятные сюрпризы, но прямые руки решают вопрос.
Возможно будут различаться пакетные менеджеры, но в целом синтаксис команд похож, да и у гугла можно спросить как и что выполнить в конкретном дистрибутиве.
Возможна отличия в некоторых директориях, а также в уровне доступа к некоторым командам, ну и некоторые программы буду, в зависимости от установленных пакетов.

Я не вижу скажем так всей картины, но есть такая вещь - playonlinux. Весьма спасает после вот таких неожиданных "приветов". В общем в playonlinux можно выбрать версию wine и бывают версии с определёнными патчами. А ещё есть скрипты установки, которые подключают именно те родные библиотеки, которые нужны для данной игры.
Как правило DirectX нужно устанавливать из winetricks, чтобы не было таких проблем.
А ну и все приложения в playonlinux живут своей отдельной жизнью в отдельных папках и если вдруг экспериментируете с winetricks для одного приложения, то другое не пострадает.

Попробуйте задать вопрос разработчикам компонентов. Вроде бы их старый форум не умер ещё www.da-soft.com/forums/anydac-osnovnoj-russkij.html

Я работал с FireDac когда они были ещё AnyDAC и проблем с различными СУБД не возникало. Компоненты надёжные, дают высокий уровень абстракции от конкретного движка СУБД, что позволяет работать с двумя разными БД из одной программы без проблем. А в самом низу, если докопаетесь до исходников, будет видно, что работают компоненты с самыми что ни на есть нативными методами, которые доступны в libpq.
Так что проблем у вас быть не должно(ну разве что баги в самих компонентах, но тут уж без этого никуда - никакой страховки нет).