Как в графане настроить алерт на всплески ошибок?

Скорее всего у него источник elasticsearch. Конечно мониторить через логи может не совсем правильное решение. Но с другой стороны метрики на вызов методов, да ещё с их анализом по респонсу только по логам можно мониторить.

Почему не обновляется прошивка на Mikrotik 951G–2HnD?

Посмотрите в:
/system - scripts
/system - scheduler
/tools - netwatch