anggyre

Правильнее всего в данном случае сначала определиться что именно Вы хотите приготовить (например суп с клецками), затем уточнять под это блюдо рецепт/ингредиенты.

В SEO блюда чаще всего бывают следующими:
- продвинуть site.ru по списку запросов XXX в поисковой системе Яндекс в регионе Москва
- вывести поисковый трафик на site.ru на YYY хостов (посетителей)/сутки
- вывести site.ru на уровень 5 целевых звонков(заявок)/сутки

Соответственно исходя из поставленной задачи и текущего состояния сайта разрабатывается стратегия продвижения, составляется план работ. План работ - как раз то что Вам требуется для оперативного контроля + несколько сервисов для отслеживания ключевых показателей (растут позиции или нет, увеличивается ссылочная масса или нет и т.п.) - достаточно мониторить 4-7 ключевых показателей в зависимости от масштаба проекта.

CMS подбирается под конкретную задачу (в т.ч. по SEO), но не наоборот.
Если цели по SEO не сформулированы - без разницы какой движок использовать.

Это Вам сюда: tech.yandex.ru/. На семинарах/конференция можно получить исчерпывающие ответы, в живую пообщаться с яндексоидами.

Выбирайте вариант с поддоменами если нужно максимальное покрытие регионов, так делают все крупные федеральные магазины вроде mvideo. Вдруг с каким-то поддоменом перестараетесь и попадете под фильтры ПС - на остальные это не будет распространяться.

Ситуация абсолютно нормальная - так происходит на всех сайтах.
Проверьте через яндекс метрику есть ли польза от таких переходов:
- добавление товаров в корзину
- просмотр важной информации (контакты, условия оплаты/доставки и т.п.)
- другие полезные действия

Соответственно поймете есть толк от такого трафика или нет.