andead

Нет. Поскольку формы должны работать с отключённым js, то скрытая кнопка это нормальный способ вызвать ajax.

но, насколько я понимаю, это единственное преимущество

Второе преимущество - меньше размер html, быстрее загрузка (css же кэшируется)
Третье преимущество - можно применить миксин только для определённого media, с классом так не получится и придётся переопределять все свойства.
Четвёртое преимущество - не надо править html разметку при изменении дизайна.

Вообще эти способы существуют параллельно. Классы используют в БЭМ и например в бутстрапе, миксины в Semantic UI и том же бутстрапе.

Тема работать не сможет. Проблем будет куча.
Проще создать новый сайт и перенести контент с помощью модуля Migate.

Делайте на php-фреймворке. Любой перечисленный движок не предоставляет требуемый функционал.

В одиночестве на друпале вы такое в ближайшей перспективе не осилите

Сразу превращать в шаблон. Отдельно вёрсткой для друпала занимаются только извращенцы.

Так как в тегах друпал, отвечаю про друпал — вы попробуйте натянуть хоть один свёрстанный шаблон на готовый сайт. Вы всё поймёте через по часа :) Если лень, отвечу сразу — свёрстанный шаблон для друпала не нужен.

https://www.drupal.org/project/browserclass
добавляет токены браузера, ос и информацию о девайсе