class Category(models.Model):
    parent = models.ForeignKey('self', null=True)
    title = models.CharField(...)

class Product(models.Model):
    title = models.CharField(...)

Яблоко Гольден, это товар категории Фрукт, подкатегории Яблоко, подподкатегории Гольден.
Гибрид, это подкатегория имеющая две родительские категории. Следовательно: parent = models.ManyToManyField('self', null=True)

Лучший сорт - это просто булевое значение ->

# in class Category
is_best = models.Boolean(default=False)

Начните с изучения нормальных форм данных.
вики

Бизнес-логика в базе - это такое себе. Логика может меняться, усложняться, становиться динамической. По возможности, приложение не должно знать о базе.