Алексей Уколов

URL на директориях и файлах - это тяжелое наследие древних времен, которое осталось только в таких гигантах передовой мысли, как Битрикс.
Я вообще расширение не использую, в эру легких и удобных фреймворков можно построить любой URL, зачем его засорять ненужными деталями реализации?

Для Апача и CLI используются разные файлы php.ini, скорее всего, вы увеличивали memory_limit не там.

Вы на самом деле очень широкий вопрос задали.
Выбирать storage engine исходя из типа запроса неправильно, нужно понимать, как каждый конкретный engine такие запросы обрабатывает, какие у него сильные и слабые стороны исходя именно из ваших требований, потому что сами по себе движки не плохи и не хороши, они могут только больше или меньше подходить под конкретную задачу.
Для этого нужно почитать какие-нибудь умные книжки. Например, вот одна из лучших книг на эту тему (на русском, правда, нет самого последнего, 3-го издания, но для знакомства и это подойдет).

$array = [['height' => 1], ['height' => 2], ['height' => 3], ['height' => 4], ['height' => 5]];
$filtered = array_filter($array, function ($item) {return $item['height'] >= 3;});
echo count($filtered);

Пожалуй, начать стоит с https://refactoring.guru/ru, чтобы понимать, с чем в будущем придется столкнутся при поддержке и заложить основы на данном этапе.
Это если, конечно, скрипт длиной не 20 строк :)

Выдерживает нагрузки, расширяется и стабильно работает не "связка", а код, который вы пишете.
Хороший код можно написать на любой "связке".
Не знаю, что еще можно ответить на ваш вопрос, кроме того, что я сам пишу на L+BB.

Обьясните, пожалуйста, зачем тут нужен откат транзакции, если все изменения фиксируются при коммите, а исключение и так прервет программу?

Rollback нужен не для того, чтобы прервать транзакцию, а чтобы отменить изменения, сделанные в ней. Представьте, что вы осуществляете внутриигровую покупку - платите пользователю 100500 галактических кредитов, а он вам за это отдает Банхаммер Добра и Света. Только вот на середине транзакции произошел сбой - какое-то исключение выбросилось. Деньги с вас списались, а вот предмет владельца не сменил. Именно в этот момент транзакцию нужно откатить - вы же не хотите остаться без денег?

Проблема в том, что вы не понимаете, что utf8 - это мультибайтовая кодировка и к буквам utf8-строк в php нельзя получить доступ через порядковый номер.
Если вам нужна вторая буква должно быть так:

$word = 'борода';
echo $word[2].$word[3];

Но предпочтительнее, конечно, нормальный вариант:
echo mb_substr($word, 1, 1, "UTF-8");

Не очень понятна схема, по которой начисляются проценты, но если копировать вашу, то я бы написал так:

$debt = 40000;
$interestRate = 1.03;
$serviceFee = 1000;

$monthlyPayment = 5000;
$totalPayment = 0;

$month = 1;

while ($debt > 0)
{
	if ($debt > $monthlyPayment)
	{
		$debt = ($debt * $interestRate) + $serviceFee - $monthlyPayment;
		$totalPayment = $monthlyPayment * $month;		
	}
	else
	{
		$totalPayment += $debt;
		$debt = 0;
	}

	echo sprintf('Спустя %d мес. мы должны банку еще %1.2f руб.', $month, $debt);
	echo ' // ';
	echo sprintf('Выплачено нами %1.2f руб.', $totalPayment);
	echo '<br/>';

	$month++;
}

$credit = $credit - $credit;

Вы замеры проводили, насколько file_exists медленный? Преждевременная оптимизация - корень всех зол.

Первая и самая главная ваша проблема - в неумении расставлять теги к вопросу.
А что касается скрипта, похоже, что вы просто не проверяете была ли заполнена форма или страницу с формой просто открыли и пытаетесь записывать в файл несуществующие данные.

Код, который вы привели, никак не связан с постоянным обновлением страницы. Если создать пустой файл и вставить туда только этот код страница продолжает постоянно перезагружаться?