вы просите nginx пробовать $uri, потом $uri/, потом /index.php. если существует /index.php, тогда 404 не будет никогда, даже, если $uri и $uri/ не существуют
у провайдера ночью скорость была гигабит, отдавал по терабайту в сутки на торрентах. жесткий диск умер быстрее, чем провайдер дернулся, отдано под петабайт