Андрей

Устанавливайте свою куку на company.ru, а не на .company.ru и тогда браузер не будет передавать куку на *.company.ru

А надежнее всего сделать для этих случаев отдельный домен.

Asterisk или FreeSWITCH вполне с задачей справятся.
Их можно на некоторые маршрутизаторы и NAS-ы поставить.