Если хотите работать над сеткой и шрифтами, то sketch - там прекрасно назначаются стили и символы для изменения на всех страницах.
Но прототип реально этого не требует. Если он реально детализирован, то внимание уделяется взаимодействию с элементами, а не их дизайну. Если вы будете работать на этапе прототипа с кеглем, сеткой и вертикальным ритмом, вы завязнете в этих деталях и можете упустить реально критичные детали UX. Шрифты и отступы на этом этапе ставятся грубо - лишь бы в экран влезало.
Поэтому набрасывайте лучше в Axure RP/
Главное, донести этот подход для клиента. :)