Это больше похоже на какую-то проблему в самом MSI. Возникает
у разных людей с совершенно разным софтом. Однозначного решения проблемы, как я понял, нет. Надо пробовать разные методы. Кому-то помогает утилита Windows Installer Claeanup (msicuu.exe), кому-то нет. Если у Вас что-то после гугления получится, отпишитесь.